Pauser i vejrtrækningen under søvn er ikke umiddelbart farlige – der er ikke nogen, som ikke af sig selv trækker vejret igen. Men lidelsen må anses for farlig, fordi man har fundet en øget dødelighed og forekomst af kroniske sygdomme hos personer, som lider af søvnapnø. Det har sammenhæng med, at man finder en hyppigere forekomst af forhøjet blodtryk og hjerte/karsygdomme, ligesom der ses en betydelig øgning af ulykkesfrekvensen, specielt trafikulykker.